Podmienkou pre bezpečné kúpanie v prírodnej vode bez chemických prípravkov je fungovanie biologických procesov. Ich výsledkom je nezávadná voda, ktorá musí spĺňať limity pre koliformné baktérie, escherichia coli, črevné enterokoky a iné. O zníženie týchto limitov sa starajú nitrifikačné baktérie, ktoré v rámci nitrifikačného a vzápätí denitrifikačného procesu zabezpečujú požadované hodnoty.
Výsledkom tohto procesu je aj čistá, priezračná voda bez akýchkoľvek rias. Pre život aeróbnych baktérií je potrebná určitá plocha, na ktorej sú osadené. Pre svoje fungovanie potrebujú nevyhnutný kyslíkový režim, ktorý by nemal byť menší ako 6 mg/l. Celková reakcia vody v kúpacích jazerách by nemala klesať pod pH 7, skôr by sa mala pohybovať medzi hodnotami pH 7 až pH 7,5. Je dôležité s akými hodnotami vstupovej vody sa pracuje, ktorá bude súčasťou kúpacieho biotopu. Je všeobecne známe, že tvrdšia voda má pevnejší chemizmus a nedochádza v nej k náhlym výkyvom celkovej reakcie vody, čo tiež vplýva na celkové fungovanie biologických procesov.
V kúpacích jazerách sa používajú prírodné absorbery škodlivých a nepotrebných látok, ktoré sú súčasťami substrátov. Dôležitá je cirkulácia obiehajúcej vody, ktorej prietok a množstvo sa musí citlivo nastaviť pre fungovanie biológie. Čerešničkou na torte je fytomateriál, ktorý sa poslednou mierou podieľa na spotrebe živín. Kúpací biotop by sa mal správať oligotrofne t.z. na nízkych živinách, pričom by mala byť aj skladba a množstvo rastlín prispôsobená týmto podmienkam. Pre fungovanie rastlín a ich koreňového systému je potrebné splniť tiež niekoľko potrebných vecí, aby fotosyntéza bežala bez problémov, ako je množstvo CO2, prístup k prítokovým živinám atď.
Veľkým podielom pri všetkých procesoch v kúpacích biotopoch je aj činnosť fyto a bioplantkónu. Ten sa tiež nemalou mierou podieľa na čistote a dobrom zložení používanej vody, ale zase potrebuje pre svoju činnosť určité podmienky, ktoré mu treba vytvoriť.
Súhrn všetkých biologických procesov v kúpacom jazere musí mať svoj zmysel. Jednotlivé procesy nasledujú za sebou, podieľajú sa na celkovom chemizme používanej vody a sú súčasťou prírody, ktorá nás obklopuje. Fungovanie každého jedného procesu sa nedá obísť ani nahradiť.
Toto môže zabezpečiť len odborník, ktorý má dlhoročné skúsenosti práce s takouto vodou.
